Семён Зиновьевич Калиниченко родился 17 (30) сентября 1915 года на хуторе Призов Юрьевской волости Екатеринославской губернии.
В 1932 году окончил 7 классов школы в городе Павлоград (Днепропетровская область), в 1935 году — 3 курса Харьковского геодезического рабфака, в 1936 году — 1 курс Харькоского института железнодорожного транспорта.
В армии с августа 1936 года. До июля 1939 года обучался в Чугуевской военной авиационной школе лётчиков
Служил в ВВС младшим лётчиком-наблюдателем и стрелком-бомбардиром в бомбардировочных авиаполках (в Орловском и Закавказком военном округах.
В августе 1941 года в должности стрелка-бомбардира 6-го дальнебомбардировочного авиационного полка участвовал во вводе советских войск в Иран.
Участник Великой Отечественной войны: в декабре 1941 — феврале 1943 — штурман экипажа и штурман звена 6-го дальнебомбардировочного авиационного полка.
В декабре 1942 года был ранен в левую ногу.
В феврале 1943 — мае 1945 — штурман звена, штурман авиаэскадрильи и штурман 367-го бомбардировочного авиационного полка. Воевал на Северо-Кавказском.
За время войны совершил 250 боевых вылетов (198 — на бомбардировщике Ил-4 и 52 — на бомбардировщике Пе-2) для нанесения ударов по живой силе и технике противника.
За мужество и героизм, проявленные в боях, указом Президиума Верховного Совета СССР от 18 августа 1945 года капитану Калиниченко Семёну Зиновьевичу присвоено звание Героя Советского Союза.
После войны продолжал службу в ВВС штурманом бомбардировочного авиаполка.
В 1949 году окончил Краснодарскую высшую офицерскую школу штурманов ВВС. Служил штурманом отдельного разведывательного авиаполка (в Белорусском военном округе). С февраля 1958 года подполковник С. З. Калиниченко — в запасе.
В 1960—1962 годах работал экскурсоводом павильона "Транспорт СССР" на ВДНХ, в 1962—1980 — начальник отдела кадров и помощник директора по кадрам издательства "Лёгкая индустрия".
Жил в Москве.
Умер 8 мая 1996 года. Похоронен на Хованском кладбище в Москве.
