Село Навагинское находится в Шаумянском сельском поселении Туапсинского района Краснодарского края.
Село Навагинское зарегистрировано в списках населенных пунктов решением Краснодарского крайисполкома от 26 апреля 1962 года
По сведениям на 1 января 1987 года в селе Навагинское проживало 400 человек.
В 2010 году население составляло 347 человек.