2016-2018, прекратил свое существование с главной командой
Из истории:
В 1990-е фарм-клуб "Кубани" под названием "Кубань"-д играл в третьей лиге в сезонах 1996 и 1997, прекратив в итоге выступления на профессиональном уровне ввиду расформирования турнира (реорганизации системы лиг).
В июне 2015 года был воссоздан на базе команды армавирского "Торпедо". Успешно пройдя лицензирование в РФС и ПФЛ, был зачислен для участия в турнире зоны "Юг" Первенства ПФЛ 2015/16. При подготовке к сезону стал финалистом товарищеского турнира в п. Афипском. Согласно календарю команда должна была дебютировать в зоне "Юг" ПФЛ 20 июля в выездном матче против пятигорского клуба "Машук-КМВ". Однако 11 июля появилась информация, что всего месяц как возрождённый фарм-клуб "Кубани" снялся с розыгрыша, так и не проведя в итоге ни одного официального матча.
16 июня 2016 было официально объявлено о воссоздании команды.
По итогам сезона 2016/17 команда заняла последнее, 16 место, заработав 23 очка. В следующем сезоне "Кубань-2" стала последней в лиге.
