Проект Епархиального женского училища разработал архитектор Василий Филиппов. Здание в псевдорусском стиле отличается живописностью кирпичного декора. Его построили в 1898-1901 годах.
В период Гражданской войны в здании размещали госпиталь. С 1920 года его используют по первоначальному назначению – как учебное заведение. В годы Великой Отечественной войны и оккупации Краснодара дом частично разрушили. Его восстановили в 1947-1952 годах.
Долгие годы здесь располагался Кубанский государственный медицинский университет.
В 2022 году началась реставрация здания.