Василий Матвеевич Агиенко родился 12 декабря 1903 года в станице Некрасовская ныне Усть-Лабинского района Краснодарского края в крестьянской семье. Украинец.
Образование начальное, окончил 3 класса. С детских лет жил на хуторе Пустосёлов Красногвардейского района ныне Адыгея.
В 1925-1927 годы служил в Красной Армии. Вернулся в Пустосёлов. Стоял у истоков создания в хуторе школы, сельского клуба и библиотеки. В действующей армии со 2 сентября 1941 года.
Минометчик 266-го гвардейского стрелкового полка, 88-я гвардейской стрелковой дивизии, 8-й гвардейской армии 3-го Украинского фронта гвардии рядовой Агиенко 16 марта 1944 года под огнём переправился в составе расчета на правый берег реки Ингул в районе села Христофоровка, Николаевская область. При отражении контратак уничтожил пулемет с прислугой и свыше 10 солдат. 22 марта 1944 года приказом командира 28-го гвардейского стрелкого корпуса Морозова С.И. награждён орденом Славы 3 степени.
Командир расчета 82-мм миномета 266-го гвардейского стрелкового полка, 88-я гвардейская стрелковая дивизия, 8-я гвардейская армия, 1-й Белорусский фронт, гвардии младший сержант Агиенко 14 января 1945 г. у населенного пункта Геленувек в Польше вместе с бойцами, из миномета подавил 2 пулемета с расчетами и истребил до 15 солдат противника. Наследующий день, у населенного пункта Стромец, вместе с миномётчиками капитана И. Г. Остапенко отразил 9 вражеских контратак. По представлению командира полка Субботина И. П. приказом командующего 8-й гвардейской армии Чуйковым В.И. 27 февраля 1945 года награждён орденом Славы 2 степени.
Командуя миномётным расчётом, гвардии старший сержант Агиенко в бою 16 апреля 1945 года в районе Зеловских высот (вольварк Вердер) Германия огнём из миномета накрыл группу фашистов и 3 пулеметные точки. 15 мая 1946 года Указом Президиума Верховного Совета СССР награждён орденом Славы 1 степени.
После войны был демобилизован. Жил и работал на хуторе Пустоселово учётчиком тракторной бригады колхоза "Свободный труд" в Республике Адыгея.
